京兆府，王允高坐正堂，大声质问着堂下被绑着的人：
“现在董卓被诛杀，不只是长安城的喜事，更是全天下的喜事！所有人都在欢呼，为什么你要在那里叹息落泪呢？你身为汉臣，难道不知道董卓是国贼吗？”
被王允质问的，正是蔡邕。
此前，董卓的尸首被朝臣们让人丢弃在长安城正中人来人往的大街上。长安城中有不少百姓是被董卓从洛阳驱赶到长安城中，他们在洛阳的家财都丧失了。在迁到长安的路上，甚至有不少人饿死病死了。这些人对董卓的恨意不比朝臣们少。
董卓喜怒无常又残暴，很多被董卓处死的人的亲朋好友，自然也是对董卓很憎恨。
当董卓的尸首被抛到大街上时，路过的百姓都要在他的尸首上踩上几踩。太阳暴晒下，董卓肥胖的身体流出了油脂，特别是肚脐眼的位置上，蓄满了一层油乎乎的油脂。有的人在董卓的肚脐眼上的油脂中放上一条灯芯，然后点燃，灯芯吸油，就像点蜡烛一样，灯芯上的火焰烧了很久。
那些以前围在董卓身边的人，没有一个人过来给董卓收尸，都避得远远的，害怕受到牵连。只有蔡邕，看董卓死后那个的样子悲伤叹息。
当所有人都在庆祝时，蔡邕的行为就显得很反常，很快就被人报告到王允那里去了。王允等人正在张罗着清理董卓余孽，当然不能容忍蔡邕这样的行为。所以王允立即派人将蔡邕抓了起来。
京兆府，蔡邕听到王允的质问后，回答道：
“董卓是国贼，这我知道。我只是看到董卓以前那么风光，而如今落到这下场，再想起董卓以前对我的礼遇有加，不竟感伤起来。绝对没背叛朝廷的意思啊！”
王允大声说道：
“你为董卓感伤落泪，就是为董卓感到可惜，你希望董卓继续祸乱朝纲，你这就是叛逆！你这是死罪！”
蔡邕的才气闻名天下，边上的人觉得杀了蔡邕太过了，马日磾劝王允留蔡邕一命：
“王允徒，蔡邕是旷世奇才，他的才名天下皆知，杀了他，恐怕会让天下人不满啊！再说，蔡邕现在正在写汉史，不如处罚他一下就算了，留他一命，就像当司马迁那样，让他留着性命写完史书也好啊！”
王允拒绝道：
“留他活着给董卓在史书里说好话吗？这样只会让后人觉得我们这帮人不行，反而觉得董卓这样的人做得对。这样就更不能留他性命了！”