郡守麾下有纲纪系统、门下系统、列曹系统、监察系统。
其中，纲纪系统，相当于现在的人事，其主官为功曹，或叫功曹史。
功曹权力之大，一度在东汉引发争论。
因为汉代官制规定，每郡置太守一人，各郡皆置诸曹掾史。最高长官郡守由中央任命，且要避免任用本籍人士，而诸曹掾史则由长官自行任命本地的贤士。
桓帝之时，汝南、南阳二郡曾流传着一首歌谣：汝南太守范孟博，南阳宗资主画诺。南阳太守岑公孝，弘农成瑨但坐啸。
其意便是说，范滂（字孟博），岑晊（字公孝）两个功曹成了实际上的郡守，而真正的太守宗资、成瑨则成了坐堂画勾之人。
诸侯讨董的时候，广陵太守张超麾下的功曹臧洪也一度成为倡导者，如果说袁绍是整个联盟盟主，那臧洪便是酸枣这一支的分盟主。
功曹手下有书佐，负责各曹官吏的档案官吏。
除此之外，纲纪系统中还有五官掾，掌春秋祭祀，若功曹史缺，或其他各曹员缺，则署理或代行其事，无固定职务。其意大抵是不管部部长。
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纲纪系统之下是门下系统。
门下，顾名思义，这是离太守最近的一批办事人员，只隔着一道门。它由太守直接控制，属于郡政府的核心
门下系统的主要官吏就是主簿，相当于是现在的办公厅厅长，或者秘书长。
所以主簿也算是主官最亲近的人，三国出名的主簿有吕布、杨修、陈琳、黄权之类，皆是一时俊杰。
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门下系统之下就是列曹，是郡政府的直接办事部门。
当然，按照时情和地域的不同，列曹也有所不同。
就比如，人多的地方，单单管理民生就有：户曹，时曹，田曹，比曹，水曹，将作掾，决曹。
东汉将内地郡郡尉一职撤销，相对应的列曹中就有了兵曹、尉曹。
若有重大灾疫发生，也会设置医曹。
正因为如此，所以边柳在大帅府下设置多部门，并没有让郭嘉卫兹等人感到奇怪。
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除上述三者，还有就是监察系统。
其负责人为督邮，又叫督邮书掾或者督邮曹掾，算是比较独立的列曹之一。他们负责在郡县之间传递邮件，同时也负责检查县政府的工作。许多时候，他们也可以临时兼任催收赋税的工作。
三国最出名的督邮自然是被刘备鞭打的那个。
这里值得一提的是，事实上，向刘备索贿的并不是督邮，而是汉灵帝，因为汉灵帝觉得这些人因为征讨黄巾的微功就当上了郡县长吏，而没有给他交“卖官鬻爵”的钱，他亏了。
《典略》记载：其后州郡被诏书，其有军功为长吏者，当沙汰之。