皇帝很清楚解刳院没有问题，张居正也很清楚，但大明百姓并不清楚，张居正以内阁的名义请旨调查，其原因也非常简单，就是杜绝阴谋论的蔓延，给这件事下一个最终定性。
这一次大明皇帝的病危，是一场巨大的危机，对于刚刚从泥潭里站了起来的大明而言，作为新政向心力的那个中心，陛下一旦出问题，大明就立刻向不可知的深渊滑落，帝制素来如此，兴衰和皇帝个人关系极大。
大明度过了一场浩劫，要对这场浩劫有一个最终的官方结论，那么阴谋论就没有了滋生的土壤，这样对所有人都好。
包括陛下本人。
大明皇帝有点太小看自己现在的影响力了。
一個非常简单而直白的例子，草原上现在有一条共识，那就是可以反汉，但是不能反对陛下，在草原上依旧广泛存在着北虏和汉民之间的矛盾，主要是因为生产资料的矛盾，土地、草场、碱池、矿山等等，都是矛盾爆发的诱因。
但草原上不能反对陛下，因为现在的安定生活都是陛下和陛下的天兵天将带来的，这是侯于赵的一个大明、皆为王臣的最大共识，只需要两三代人，只需要生产资料分配完毕，就会从你中有我、我中有你，变成浑然一体，再无法区分彼此了。
张居正要进行调查的原因，就是为了防止阴谋论的滋生，因为刺王杀驾案的存在，民间有很多人认为是王崇古和他的外甥张四维一样在刺王杀驾，所以就需要调查，需要一个结论。
很快，经过了数番审查，解刳院的审查结果，那就是解刳院，没有问题。
陛下出现了风寒和感冒的症状，是因为陛下身体过于强壮导致的排异反应，就是人对进入身体的异物或药物产生的不良反应，而且是超急性的排异，陛下的这轮排异反应，大约可以解释为免疫系统在虚空索敌，而皇帝陛下本身十分强壮，导致了这种发热。
陛下的横生牙缝了三针，就是这三针的线，导致的这种现象，一般人只会局部发炎，或者疼痛。
解刳院的大医官都很好奇，皇帝到底是怎么挺过来的，一般来说，手术过后出现发热症状，基本可以白布一盖，准备后事了，李时珍看了都只能说，等死吧，没救了。
当然解刳院的大医官虽然觉得皇帝陛下很特殊，但没有任何大医官说，他们希望解剖皇帝。
解刳院在皇帝手术中没有任何的问题，但张居正在调查中发现，解刳院在违规操作，解刳院有相当多的规章制度，药品的管理非常的严格，镇痛药物甚至需要三个人互相监督才能支取，很多规章制度，是因为解刳院给皇帝看病而专门设立。
解刳院的违规，主要是集中在了实验上，解刳院明令禁止，任何大医官不得以自己为样本进行试药，皇帝陛下苦心搜集了那么多的都不能称之为拟人的畜生，凌迟犯，送进解刳院就是让大医官做实验的。
但解刳院的大医官普遍存在拿自己试药的现象，比如已经脱离了观察期的大医官庞宪，在进行了反复验证后，将牛痘种植在了自己身上，获得了天花的免疫。
“所以先生，要责罚医者仁心的大医官吗？他们是对自己的实验负责，才会用自己试药，先生怎么忍心责罚他们呢？”朱翊钧两手一摊，张居正要求惩处这种行为，大明皇帝不同意。
“陛下，每一个大医官都是众人异样的目光中，走进了解刳院里，研究生物无穷之理，他们每一个都很宝贵，而标本，是非人的畜生，阵亡在长崎的每一个军兵，都是大明的忠骨义士，无论死多少倭寇，都无法抵消倭人这份罪孽，织田家、毛利家，整个倭国，都要付出代价！”张居正非常执拗，仍然要依规处置，这是处罚，更是保护。
而且张居正用这次长崎之战作为例子说服陛下，处罚是为了禁绝这种风气。
“大医官弄出来的药，疗法，有些需要用到朕和皇亲国戚身上，比如剖腹、比如陈卤水、比如大蒜素，但凡是出些问题，就会连累家人，是死在试药之下，还是药死了朕全家陪葬？这对大医官们而言，是个显而易见的选择。”
“先生，罚的轻了不管用，罚的重了，朕不乐意。”朱翊钧仍然坚持不给惩处，这涉及到了惩罚力度的问题。
罚的轻了，这条禁令就形同虚设了，等于说：只需要付出微不足道的代价，就能换来违禁的权利。
比如一些个国贼，只要他不死，那就一定有人会前赴后继的以身试法，而且有这个国贼在，就无法把禁令执行下去，人不患寡患不均，他这个国贼不死，凭什么处置我们？
王崇古老是说：杀人真的有用，因为杀人就是明正典刑，就是明确禁令的不可触碰，是让国法变得更加庄重，和稀泥只能获得短暂的平静，而后情况会越来越糟糕。
“那臣请陛下下旨，再次申明解刳院上下，必须依例做事，若是再犯，则赶出解刳院。”张居正无奈的说道：“陛下，天下从来不缺少规矩，缺少的是让人普遍遵守的办法。”
制定的条例不执行，那为何要制定条例？看样子吗？
张居正也没办法，陛下不肯，他也不能强行推进，只能依陛下所言，他退而求其次，若能求到严明条例的圣旨，也足够了。
朱翊钧和张居正这对儿君臣，也不总是意见一致，分歧是常态，很多时候都是朱翊钧赢。
“朕下旨有用吗？”朱翊钧倒是愿意下这份圣旨，但是不知道有用没用。
“陛下，下旨真的有用。”张居正十分肯定的说道，下旨真的有用，陛下的信誉和威信都在，下旨严明，大医官们也不会堂而皇之的违背条例了。
解刳院不被大明礼法所容，身体发肤受之父母，这可是儒家的圣训，可以说解刳院是完全建立在皇帝庇佑之下存在，所以皇帝说话当然管用。
“牛痘的成果如何？”朱翊钧示意内书房的禀笔太监拟旨，他看过后再下印，聊起了关于牛痘种植和推广之事。
张居正神情极为振奋的说道：“臣从解刳院了解到，天花也分为几种，都是天花，可即便是轻症也有超过30%的死亡率，若是严重或者出血，必死无疑！以山西大同五里寨为例，万历八年爆发天花，最后封闭城门，再打开时，一万五千丁口，只剩下五千人了。”
“若是牛痘真的有用，当真是生民无数，岐圣再世！”
“以何等论功？”朱翊钧作为后来者，他其实对天花的可怕和天花造成的危害，无法感同身受，因为他没有经历过，后世是一个没有天花的世界，而且连牛痘都不种了，肩膀上种的花是卡介苗，不是牛痘。
朱翊钧无法理解时人对天花的恐惧，但朱翊钧经历过生死，他知道，死真的很可怕，生死之间有大恐怖。
“一等功赏！”张居正十分确切的说道，今年的技术进步奖已经名花有主了，甚至等不到过年颁发了。
庞宪代表解刳院拿下一枚一等功赏奇功牌。
“陛下，在天花爆发的地方，只能封闭城门，无论老幼妇孺，都要关在城里，直到每个人都感染、病发、死亡，等于说是…朝廷抛弃了黎民，现在终于有办法了。”张居正攥着拳头，用力的说道。
从封闭城门，再到开启，是三年时间，大疫三年。
天花爆发的地方，都是死绝之地，任何一个城池经历了天花，都要废弃一段时间，这也有了各种天弃的传说。
朱翊钧的农学老师徐贞明的老师马一龙，曾经说过，人力胜天。
老天爷抛弃了此方黎民，但是朝廷不抛弃此方黎民。
天弃人不弃！
牛痘法真的有用，当牛痘法广泛使用的那天，陛下就是立刻宣布自己是真武大帝转世，也有大批的拥趸，坚信不疑。
战争、瘟疫是杀死人类的最大杀手，旗鼓相当，不相伯仲，往往相辅相成。
“庞宪，终究是要青史留名了，他是第一个种痘者。”朱翊钧朱批了张居正为解刳院集体请功的奏疏。
三娘子还没走，她一直在等庞宪结束观察期后，和庞宪了解这种法子的结果，草原也深受其害，天花从汉朝的时候，就被叫做虏疮，意思是从北虏匈奴传来的恶疾。
草原上，天花肆虐。
人痘接种防治天花有四种，痘衣法、痘浆法、旱苗法、水苗法，每一种都是用的人痘病毒，极其危险，而牛痘法几乎不起痘，更不会致命，这就是牛痘法的奇妙之处。
“那就先试试吧，从京师开始推而广之。”朱翊钧决定先试点，还是从京城开始。
崇祯年间，因为空前的少雨多旱，蚊虫老鼠泛滥成灾，从山西为源头的大瘟疫时代来临，伴随着旱灾，百姓不得不迁徙，瘟疫被带到了华北平原，这场瘟疫既是大鼠疫，也是天花肆虐，因为当时有疙瘩瘟之称。
崇祯十四年，沿街小户，收掩十之五六，街坊间的儿为之绝影。有棺无棺，九门计数，二十余万也。
京城爆发了超过超大瘟疫，十家里有五六家都要收掩埋尸体，街上房间看不到一个人，有棺材的、没棺材的死人，光是九门计数，就超过了二十万。
崇祯十六年八月到十二月，再次爆发瘟疫，以最保守估计，和崇祯十四年的规模相当，李自成在攻破大明帝国的京师时，没有遭遇到任何抵抗，因为他面对的是一个‘白骨道旁、人鬼错杂，日暮人不敢行’的死城。
王希元跑到皇帝这里诉苦，说自己苦，自己累，顶不住了要致仕，是因为他肩上的责任真的很重，王一鹗那会儿京师人口密度还比较低，沈一贯的任期极短，王希元是真的接了个烫手山芋，越来越多的人口，防疫也是一个巨大的考验。
王希元是事务官，要处理这些事，处理不好就要担责任。
“《荀子·王制》曰：草木荣华滋硕之时，则斧斤不入山林，不夭其生，不绝其长也，此为圣王之制也；《管子》曰：山泽各致其时，则民不苟。”
“陛下，这两年京师肉眼可见的绿了起来。”张居正谈到了环保，说起了京师肉眼可见的变化。
荀子在王制一篇中提到，草木繁荣生产的时候，斧头不要入山林，这是法自然的圣王制度，山泽要在适当的时间适当的开发，在草木生长的时候把它砍伐，是违背自然的。
法自然是先秦诸子的都认可的共同认知。